喀什地区烟草专卖局、新疆维吾尔自治区烟草公司喀什地区公司成立于 1999年7月。2003年1月，喀什地区公司改制为自治区烟草公司的全资子公司。2005年l月，喀什地区公司与克孜勒苏柯尔克孜自治州烟草公司进行业务整合，成立了新的喀什地区烟草公司，管辖区域覆盖三个地、州、市，即:喀什地区、克孜勒苏克尔克孜自治州和图木舒克市。喀什地区烟草专卖局（公司）内设9 个职能科室，公司下属 16 个县（市） ，分别是叶城县、泽普县、莎车县、英吉沙县、阿克陶县、伽师县、岳普湖县、麦盖提县、塔什库尔干县、疏勒县、喀什市、疏 附县、乌恰县、阿图什市、巴楚县和图木舒克市。其中，塔什库尔干县未成立烟草专卖局。公司共有从业人员 246 人。

2012 年，共完成卷烟销量 77012 箱，实现税利 15203 万元，实现利润 4657 万元。