2004年7月1日原日喀则地区烟草公司与日喀则地区专卖局合并，并上划自治区烟草专卖局（公司）。日喀则地区烟草专卖局（公司）设办公室、人事劳资科、财务审计科、专卖管理科、销售管理科、安全保卫科、信息中心7个科室，下设5个配送中心，分别为拉孜配送、江孜配送、定日配送、萨嘎配送和城区配送，全市18个区县县级及主要公路沿线零售客户均由城区配送中心集中访销统一配送，江孜、拉孜等4个配送中心负责各自辐射区域内的乡村零售客户的访销配送。现有员工128人。