大理州烟草专卖局（公司）成立于1984年1月；1992年11月，大理州烟草专卖局、云南省烟草大理州公司和大理卷烟厂合并，实行“三合一”管理体制；2003年10月，“三合一”分设，州烟草专卖局、州烟草公司实行两块牌子、一套班子合署办公，负责辖区内的烟叶生产经营、卷烟销售和烟草专卖管理。

下辖大理市、祥云县、宾川县、弥渡县、漾濞彝族自治县、南涧彝族自治县、巍山彝族回族自治县、永平县、云龙县、洱源县、剑川县、鹤庆县１２个县级烟草专卖局（分公司）；局（公司）本部设办公室，企业管理部，组织人事劳资部，党群工作部，监察部，烟叶生产管理部，烟叶经营部，烟叶质量监督检测站，烟叶技术中心（下辖：弥渡红大科技园），卷烟营销中心，大理州烟草公司物流分公司、大理烟草物流园，现代烟草农业基础设施建设办公室，专卖监督管理部、内管办、稽查支队，财务部，审计派驻办，信息中心，安全保卫部，政策法规与体制改革部，整顿和规范办公室，招投标管理办公室共２０个部门。