内蒙古自治区巴彦淖尔市烟草专卖局、内蒙古自治区烟草公司巴彦淖尔市公司组建于1984年，实行“统一领导、垂直管理、专卖专营”的管理体制，“两块牌子、一套机构、合署办公”。依照《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，在全市履行烟草专卖行政管理和烟草专营职能。下辖临河区、乌拉特前旗、五原县、杭锦后旗、磴口县、乌拉特中旗、乌拉特后旗7个县级烟草专卖局(营销部)。市局(公司)内设办公室、人事科、党建工作科、群团工作科(工会办)、专卖监督管理科、内部专卖管理监督科、财务管理科、规范管理办公室、审计科、企业管理办公室、纪检监察科、法规科、安全管理科、信息中心、营销中心、物流配送中心共16个科室(中心)。