黑龙江省烟草科学研究所集科研、推广职能为一体。1984年8月 由黑龙江省烟草公司决定筹建,1985年3月27日中国烟草总公司正式批准建所，为县团级事业单位。

1995年3月28日，经国家烟草专卖局批准在黑龙江省烟草科研所的基础上建立中国烟草东北农业试验站。负责辽宁、吉林、黑龙江、内蒙烟区的烟叶科研和技术推广工作。1999年2月1日经中国烟叶生产购销总公司批准，在黑龙江省科学研究所宁安试验场建立中国烟草牡丹江良种繁殖基地。现在人员机构为：人员22人，有栽培与烘烤研究室、育种研究室 等科室；具有高级职称10人，中级4人，初级3人 。博士1人，在读博士2人，在读硕士研究生5人，研究生4人。