施肥量对烟苗的生长影响很大，过少不能满足烟苗生长对养分的需求，烟苗生长缓慢，抗性差；过多不但会造成肥料浪费，还会危害烟苗的生长，因此要做到适量施肥。目前，各地区漂浮育苗苗池大小还不统一，因此施肥量要根据苗池中水的容量的多少来确定。下面以肥料（N：P₂O₅：K₂O=20-10-20）为例来说明施肥量的计算方法：

　　例如，苗池盛1000升水，用20-10-20肥料配成100mg/L营养液，计算如下：

　　100÷20×0.1=0.5克/升水

　　0.5克/升水×1000升水=500克（肥料）

　　也就是说，需要称取500克育苗专用肥加入苗池中，所得营养液浓度就是100mg/L，其它肥料浓度也就在其中了。

　　出苗后可施入100mg/L氮素浓度的肥料，播种后第5周、第6周苗池中各加一次营养液，氮素浓度为100mg/L；移栽前2周，根据烟苗长势施肥，氮素浓度为50mg/L，每次施肥时检查苗床水位，若水位下降要注入清水至起始水位。

　　肥料施入苗池前，现将肥料倒入水桶中，然后加入清水，用干净木棍搅拌，待其完全溶解后沿苗池走向将肥料均匀倒入苗池中，稍作搅动，使其混匀。

　　（1）注意营养液pH的检测校正

　　营养液的pH在5.5-7.5之间烟苗均能正常生长，但pH在5.5-6.5之间有利于矿质元素的吸收。每次施肥后要进行营养液pH的测定，当营养液pH不符合要求时要及时进行校正。如果pH偏高，可用适量的0.1N的硫酸溶液进行校正，如果pH偏低，可用适量0.1N的氢氧化钠溶液校正。

　　（2）施肥量要适宜

　　施肥过多、过少对烟苗生长都不宜。杨绍聪研究指出肥料施用量过大，特别是在播种时一次性施入的，易使基质表面发生盐析现象，对出苗率和成活率有显著的影响，即使补苗后到成苗移栽时，烟苗的茎高、茎直径、根干重、茎干重及根冠比也是较小的。许家来研究表明,前期营养液浓度在100~125mg/L的烟苗生长势强。靳冬梅指出播种45d以后，营养液浓度不可过高，超过125mg/L会对烟苗生长产生抑制作用。

　　（3）加肥方法要正确

　　施肥时沿苗池走向将肥料均匀倒入苗池中，坚决禁止从盘面上方加入肥料。

　　（4）可适量加入微矿物元素营养液

　　微量元素也是烟苗生长不可缺少的营养元素。王将克研究指出，播种后50天，烟苗在加入三次复合肥的基础上再加入适量的硒(se)、稀土(Re)等微矿物元素部能不同程度地提高烟苗的质量，达到壮苗、提高烟抗病力的效果。白永富研究表明，烤烟播种后20d,每3个漂浮格盘,施用2.75g硫酸铜肥,可提高烟株出苗率和出苗整齐度,促进烟株生长发育。